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MRI 연말정산, 의료비 공제 가능할까? (2026년 기준)

by kjchoi 2026. 1. 18.
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MRI 연말정산 가능 여부부터 공제 조건, 실손보험 중복 처리 주의사항까지 2026년 기준으로 정리했습니다. MRI 검사비를 실제로 돌려받기 위한 정확한 기준과 신청 방법을 확인하세요.

 

MRI 연말정산은 많은 사람들이 헷갈리는 대표적인 의료비 공제 항목입니다.
MRI 검사비가 적지 않은 만큼 “연말정산에서 공제되는지”, “실손보험을 받았으면 제외되는지”, “건강검진 MRI도 가능한지”가 핵심 쟁점입니다.
이 글에서는 MRI 연말정산 공제 기준, 적용 가능한 경우와 불가능한 경우, 실제 신청 시 주의사항을 2026년 기준으로 정리합니다.

 

MRI 연말정산, 결론부터 정리하면

MRI 검사비는 조건을 충족하면 연말정산 의료비 공제 대상이 됩니다.
다만 모든 MRI가 자동으로 공제되는 것은 아니며, 검사 목적과 보험 처리 여부에 따라 결과가 완전히 달라집니다.

 

MRI 연말정산 공제 가능한 경우

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1️⃣ 치료 목적 MRI 검사

다음 조건을 충족하면 의료비 세액공제 대상입니다.

  • 질병 또는 상해 진단·치료 목적
  • 의사의 소견 또는 진단 하에 시행
  • 병원·의원·종합병원 등 의료기관에서 검사

예시

  • 허리 통증으로 신경과에서 시행한 MRI
  • 뇌졸중 의심으로 촬영한 뇌 MRI
  • 무릎 통증 치료 과정 중 촬영한 관절 MRI

이 경우 MRI 연말정산 공제 가능합니다.

 

2️⃣ 건강보험 적용 MRI (본인부담금)

MRI 검사 중 건강보험이 적용된 경우라도,
실제로 본인이 부담한 금액은 의료비 공제 대상에 포함됩니다.

✔ 공제 대상: 본인부담금
✖ 공제 제외: 보험공단 부담분

 

MRI 연말정산 공제 불가능한 경우

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1️⃣ 건강검진 목적 MRI

가장 많이 실수하는 부분입니다.

  • 단순 건강검진
  • 회사 검진 패키지
  • 이상 증상 없는 예방 목적 검사

👉 치료 목적이 아닌 건강검진 MRI는 연말정산 공제 불가입니다.

 

2️⃣ 실손보험으로 전액 보전받은 경우

MRI 연말정산에서 가장 중요한 주의사항입니다.

  • 실손의료보험으로 MRI 비용을 환급받았다면
  • 환급받은 금액은 의료비 공제 대상에서 제외

즉, 실제 본인이 부담한 금액만 공제 가능

  • MRI 비용 80만 원
  • 실손보험 수령 60만 원
    → 연말정산 공제 가능 금액: 20만 원

 

MRI 연말정산 처리 시 꼭 확인할 서류

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필수 체크 항목

  • 병원에서 발급한 의료비 영수증
  • 진료 목적이 명확히 드러나는 기록
  • 실손보험 수령 내역

국세청 연말정산 간소화 서비스에 자동 반영되는 경우도 많지만,
MRI는 누락되는 사례가 있어 직접 확인이 필요합니다.

 

부양가족 MRI 연말정산 가능할까?

다음 조건을 충족하면 가능합니다.

  • 기본공제 대상 부양가족
  • 소득 요건 충족
  • 실제 의료비를 본인이 부담

부모님·자녀의 MRI 검사비도 위 조건을 만족하면 연말정산 공제 대상입니다.

 

MRI 연말정산 공제 계산 시 유의사항

  • 의료비 공제는 총급여의 3% 초과분부터 적용
  • MRI 비용이 크더라도 기준 미달 시 공제 효과 없음
  • 다른 의료비와 합산 계산됨

따라서 MRI만 단독으로 보기보다는
연간 전체 의료비와 함께 계산하는 것이 중요합니다.

 

자주 헷갈리는 질문 정리

Q. MRI 연말정산은 무조건 되나요?
아닙니다. 치료 목적 + 본인 부담금이 있어야 합니다.

Q. 실손보험 받았는데도 신고하면 문제 되나요?
실손 수령액을 제외하지 않으면 과다공제로 불이익이 있을 수 있습니다.

Q. 회사 검진 MRI는 안 되나요?
치료 목적 소견이 없는 경우 공제 불가입니다.

 

MRI 연말정산 핵심 요약 체크리스트

  • ✔ 치료 목적 MRI인가
  • ✔ 실제 본인 부담금이 있는가
  • ✔ 실손보험 수령액 제외했는가
  • ✔ 2026년 기준 의료비 공제 요건 충족했는가

이 4가지만 확인하면 MRI 연말정산 실수는 거의 발생하지 않습니다.

 

※ 본 내용은 2026년 기준 연말정산 제도를 기준으로 작성되었으며,
세법·공제 기준은 추후 변경될 수 있으므로 실제 신고 시 최신 기준을 반드시 확인하시기 바랍니다.

 

 

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